Начало Емецкого прихода относится к древнейшим временам, но когда и кем именно была построена в Емецке церковь, с чьего благословения или повеления - неизвестно по неимению документов: три последних опустошительных пожара, бывшие в 1760, 1773 и 1808 годах, грабежи, о которых знаем слишком мало, истребили все находящиеся в церкви документы и записи, так же как и сами церкви, не оставили ничего, чем бы можно было доказать и древность первой церкви и прочее, что заслуживает внимания.

Согласно записи в писцовой книге, в 1513 году в Емецке была церковь, священником которой был Никита Ильин, и были две приходские церкви для крестьян Зачачьевской волости: Никольская и Зосимо-Савватиевская с приделом Дмитрия Солунского. Когда эти церкви построены, тоже неизвестно. Обе приходские церкви в 1686 году были перенесены в Зачачье.

В 1552-1553 годах в Сотенной книге на Емецкий стан сказано: «На погосте на реке Емце село большое, и в нем церковь Николая Чудотворца, другая церковь Дмитрия Святого. В Емце же на Емецком погосте — погост, а в нем церковь Рождества Ивана Предтечи, другая - теплая церковь Егория Великого. На погосте же двор наместнический, корчемный, двор тиунский, дворы доводчиков, да дворы христианские, беспашенные, великий диак церковный Михайло и другие. В Емецком же погосте монастырек, а в нем церковь Собор Архистратига Михаила теплая, а другая церковь Покрова Пресвятой Богородицы, а в ней игумен Мартиан, да 25 братьев ». Не в эту ли церковь Покрова Пресвятой Богородицы двести лет назад адресовал Евангелие Иван Калита, предлагая отсоединиться от Новгорода и «задатися» за Москву. Емецк, по исследованиям многих историков, по тем временам был не только большим селом, но и, можно смело сказать, «вотчиной новгородских князей».

В 1587 году в Емецком стане у Большого села, на р. Емце (по генеральному измерению и переписи земель в Двинском уезде) было два монастыря: Ивановский - женский и Покровский - мужской. Упоминается также в писцовых книгах Василия Звенигорского (1857 год) «на монастыре Покровском церковь Иоанна Предтечи деревянная сверху, а другая церковь Георгия Страстотерпца, деревянная; на монастыре 12 келий, в них живут старцы. В церквях образа, книги, свечи, колокола и все церковное строение прихожан монастыря Сийского». Под словом «сверху» следует понимать, что одна церковь была двухстатная, а из выражения «другая деревянная» следует, будто церковь во имя Георгия была особая. В приходе нет о них ясного предания.

Об этих же монастырях и древних церквах один из емецких священников Флегонт Вальнев по сведениям, заимствованным из трех старинных столбцов, принадлежащих крестьянину Василию Перевозникову (к сожалению, эти памятные древности утрачены при пожарах), на страницах Архангельских Губернских ведомостей пишет: «Святому Пророка, Предтечи Господня Иоанна и Святому Великомученику Георгию Победоносцу».

О том, что эти монастыри находились в ведении Сийского монастыря, свидетельствует грамота Михаила Федоровича за подписью дьяка Богдана Тимофеевича, относящаяся к 1616 году, в которой сказано, что «Покровский монастырь ведать Сийскому так же, как прежде Ивановский ведали, со всеми вотчинами Ивановского и Покровского».

Исходя из этого, можно лишь представить большое Емецкое село с множеством деревянных церквей, монастырей среди множества мелких деревянных дворов и изб.

Пожар 1760 года уничтожил все село. Крестьяне, принадлежавшие церкви Богоявления Господня, в которой служил в прошлом Никита Ильин, построили новую деревянную церковь во имя Богоявления Господня с такою же колокольней, а крестьяне, принадлежавшие к монастырям, построили себе три церкви: во имя Покрова Божьей Матери, во имя Иоанна Предтечи и во имя Великомученицы Параскевы.

Спустя тринадцать лет, в 1773 году, на 22 сентября, опять пожар, село и все церкви сгорели. Село вновь отстроилось, и была построена только одна деревянная церковь во имя Богоявления Господня с приделом во имя Покрова Божьей Матери.

В 1792 году рядом с деревянной церковью была заложена каменная двухэтажная церковь во имя Богоявления Господня (в нижнем этаже) и во имя Покрова Божьей Матери (в верхнем этаже). Зачачьевский житель Заборский в своем дневнике утверждает, что каменная церковь в Емецке была заложена в 1789 году, строителем ее был богатый емчанин Василий Иванович Перевозников, и нижнюю церковь святили 15 августа 1803 года при большом стечении народа. Он указывает, что емчане пекли хлебы и рыбники, варили пиво и угощали народ в ограде церкви, много было всяких яств и всех угостили изрядно.

Ночью 1 октября 1808 года Емецк вновь горел. Сгорело все село, сгорела и деревянная церковь, расположенная южнее каменной на расстоянии не более 15 саженей (примерно 30 м) ближе к реке. Место, на котором стоит каменная церковь, и близ ее, особенно за южной стороной, было местом старинного приходского, а может быть, монастырского кладбища, так как от приходской деревянной Богоявленской церкви выше по Емце саженей на 50 (105 м) находился до 1613 года Ивановский женский монастырь. Занимаемое каменной церковью место есть место деревянного острога, построенного в 1613 году. Покровский монастырь находился в полуверсте (560 м) от Ивановского монастыря. Церковь же Иоанна Предтечи была в ряду с Богоявленской в том же или около того места, где сейчас каменная. С 1760 года монастыри не отстроились и, надо полагать, крестьяне, приписанные к монастырю, вошли в состав Емецкого прихода с той разницей в наименовании, какая долгое время существовала между прихожанами; одна половина их именовалась богоявленскими, другая - покровскими.

Богоявленская церковь как церковь старая и имевшая перед другими то преимущество, что образовалась не из упраздненных монастырей, стала называться соборною. Это наименование дано было епархиальным начальством и сохранилось в некоторых документах, оставшихся целыми после пожаров. Духовной консисторией каменная церковь именовалась собором, а старшие лица - протоиереями собора.

После пожара 1808 года пострадала только что построенная каменная церковь (собор). Сгорели причтовые дома и лавки, дома крестьян, причем дома крестьян были большие, двухэтажные; много погорело мелкого скота. Из становой избы никаких документов спасти не смогли. Там были дела земельные и общинные. Жители переселились в ближайшие деревни. Кощеиха не пострадала, и многие временно стали жить в этой деревне. Крестьяне получили разрешение три года рубить лес беспошлинно. Обгоревшую каменную церковь одной из первых восстановили, начали строить дома на пепелище, исправили береговое деревянное укрепление. За несколько лет возникло новое село, набережная украсилась двумя рядами лавок, дома поставили с трех сторон квадратной площади.

В 1823 году на расстоянии 15 саженей (32 м) от церкви была построена трехъярусная колокольня по образцу колокольни Ярославского девичьего монастыря. Строительство колокольни вел В. И. Перевозников, а позднее он соединил церковь с колокольней, в основном на собственные деньги, использовались также церковные деньги и посильные пожертвования прихожан. Колокольня - довольно высокое и красивое сооружение в 28 саженей (59,7 м), одно из самых высоких в ту пору в Архангельской области. Даже было распространено среди жителей: «Посылаю поклон с емецкую колокольню». Это означало - большой поклон.

В 1825 году В. И. Перевозников отлил из одних медных пятаков колокол весом в 169 пудов (примерно 1,7 тонны), за что был судим гражданским начальством. Иван Брагин отлил на свои деньги колокол в 50 пудов (800 кг). Крестьянин Иван Михайлович Байкалов устроил в верхней церкви во имя Покрова Божьей Матери новый иконостас, стоивший по тогдашнему счету четыре тысячи рублей, и сверх того завел много разных святых икон. Крестьянин Федор Филимонович Такшеев пожертвовал на значительную сумму белого листового железа, которым были обиты пять глав на церкви с крестами и шатрами; у колокольни шпиль с крестом, главу, купол и все фронтоны обил черным железом и окрасил меденою. Кроме того, он пожертвовал в верхнюю холодную церковь большую в позолоченной раме икону Спасителя, сидящего на престоле, писанную на холсте, завел хорошие хоругви и другие вещи. За все пожертвования в пользу церкви Ф. Ф. Такшеев был награжден серебряной медалью для ношения в петлице. Некоторые из прихожан своими пожертвованиями, небольшими в частности, но значительными в совокупности, много содействовали заведению церковной утвари, ризницы, книг и других принадлежностей храма. В те времена считалось, что ничего замечательного в подношении для общего дела не было.

…Жизнь, казалось, вошла в нормальное русло, но не надолго. 19 мая 1838 года в четвертом часу пополудня, в четверг, когда народ разъехался, в Емецке начался пожар. Пока народ переезжал обратно на лодках в Емецк, пожар разгорался. А начался он с дома Михайла Кочегарова от недосмотра за разогреванием в сенях самовара. В течение трех часов все село сгорело. Дома стояли в четыре ряда, не осталось ни одной жилой квартиры. Сохранилась каменная церковь, но и у нее пострадали главы. Сохранился еще вальневский кабак, что стоял на берегу, и ниже, под угором, «Чайная», построенная на сваях. Сгорели опять стан и все бумаги по Емецку и волости. Жители расселились в ближайшие деревни, и опять было разрешено три года безвозмездно рубить лес для построек. Волостное управление и училище были переведены в Хоробрицу.

Забегая вперед, следует сказать, что горел Емецк и в 1860 году, и в последующие годы, но не настолько обширно, как прежде, и что характерно - горели становые и волостные конторы. В 1914 году сгорел один дом - волостное управление, и опять все бумаги сгорели. Вот почему так мало сведений о древнем емецком поселении - многие документы исчезли бесследно.

К 1856 году Емецкий собор был достаточно снабжен всем необходимым, и в дополнение ко всему была построена красивая ограда.

Капиталов у Емецкого прихода, положенных в вечное обращение в пользу церкви, не было. Главный из его доходов - подаяния в кружку и от аренды за 14 лавок и три амбара, построенных в 1810 году на базарной площади. Первый доход от аренды получен в 1811 году.

Лесных угодий, рыбных озер, дарственных земель и других доходных статей приход не имел. Бездоходное имущество состояло из домов, состоящих при них службах, а также из пахотных и сенокосных земель, которыми пользовались церковные причты (служители церкви и их семьи). Всей земли у них было 38 десятин (примерно 41 га), в том числе пахотной – десять десятин 1438 саженей (примерно 10,5 га), остальные - сенокосные. Документов на владение пахотной и сенокосной землей у церкви не было. Следует одно из двух: или они не были выделены, или и были, но уничтожались пожарами.

Святых мощей, явлений икон, фресковых и других почему-либо замечательных икон не было; записей, живописи, важных грамот или дарственных актов, также древних книг, писанных на пергаменте, и других каких-либо книг и вещей, почему-либо знаменитых, также не имелось. Домовых и приписных церквей не было. Была лишь одна часовня во имя Великомученика Георгия в д. Шильцово, отстоящая от емецкой церкви примерно на расстоянии в один километр, - небольшая, ветхая, ничем не примечательная. По сохранившемуся преданию, эта часовня была построена при игумене Питириме, настоятеле Сийского монастыря, около 1583 года и с его благословения, так как в те времена жители Шильцова и других соседних деревень составляли вотчину Сийского монастыря. Строительство ее будто бы связано с таким явлением: на том месте, где стояла часовня, крестьянин Козьмин из д. Шильцово видел икону Великомученика Георгия, сияющую лучезарным светом, и еще ряд других явлений. Но достоверных сведений нет, и почему там была построена часовня - неизвестно.

В 1888 году в Емецке кроме каменной церкви была построена деревянная церковь с колокольней на приходском кладбище (между Емецком и Хвостами) во имя Сошествия Святого Духа на апостолов на средства братьев Вальневых совместно с их матерью, вдовой Екатериной Вальневой, в пять тысяч рублей и 135 рублей от прихожан. Церковь была освящена 28 августа 1890 года. Внутри она была украшена лучшим позолоченным иконостасом со святыми иконами и необходимой утварью; снаружи обшита тесом и покрашена. Церковь и кладбище были обнесены оградой.

Емецкому приходу, по сведениям 1872 года, было приписано 27 деревень, начиная от Сухарева до Брусачихи, в которых проживало 805 мужчин и 970 женщин. Сравнение по деревням: какие деревни ликвидировались, какие вновь появлялись, провести невозможно, пожары уничтожили все. Можно лишь сравнить с переписью 1853 года: в приходе было 793 мужчины, 960 женщин. По сведениям за 1899 год по Емецкому приходу, мужчин было 1213, женщин - 1045. Емецкие прихожане все крестьянского сословия, государственные и все православного исповедания. Общим у всех прихожан занятием было земледелие, около 1,5 десятины (1,6 га) на душу пахотной и сенокосной земли, но оно не обеспечивало их полностью, поэтому многие имели особые занятия и промыслы, из которых главный - отхожий промысел, преимущественно в Петербург. Другие занимались выделкой кирпича и глиняной посуды, деланием кадок, ушатов, лоханей, шаек, корзин, коробов; иные занимались рыболовством, птицеводством, карбасничеством, плотничеством, кузнечеством, выделкой кож и другими промыслами. Свои изделия вывозили на базар и ярмарки в Емецк в торговые дни. Общее состояние прихожан можно считать достаточным. Земля родит хорошо при хорошем уходе. Трудолюбивый хозяин здесь всегда небеден.

Следует заметить, что бывали исключения: пожар, потеря кормильца и многое другое, приводящее к бедности. Помощь оказывали односельчане, давая возможность преодолеть беду, выручая в трудную минуту.

Несколько слов о служителях церкви. 16 апреля 1869 года появилось положение о сокращении приходов и причтов. По новому положению в Емецк назначалось быть одному священнику и одному псаломщику (до этого было два священника). В силу этого положения расписание приходов и причтов составлялось губернским присутствием по делам православного духовенства Архангельской Епархии. По расписанию к Емецкому приходу присоединили соседний Рато-Наволоцкий приход, и оба прихода стали одним Емецко-Наволоцким приходом. В составе причта объединенного прихода должны были быть два священника и два псаломщика с тем условием, что один из них жил бы при емецкой Богоявленской церкви, другой - при рато-наволоцкой Петропавловской. Первый именовался настоятелем, второй - помощником настоятеля.

События конца XVIII - начала XIX века для Емецкого прихода мало известны. Лишь о двух можно рассказать. 8 июля 1898 года была сильная гроза. Молния ударила в Емецкий собор, спалила в церкви колонну около иконы Рождества Христова и разбила кисть руки Казанской Божьей Матери, находящейся на жертвеннике. На колокольне разбила кирпичную колонку, разрушила под большим колоколом и расщепила доски просвета на восточной стороне колокольни.

С 1930 года Емецкий приход перестал существовать. С церкви сняли купола, с колокольни - колокола, разобрали примерно две трети колокольни. В помещениях церкви были склады, магазин, на втором этаже размещался кинотеатр «Ударник». Позднее здание собора приспособили под пищекомбинат.